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期刊:由视频游戏玩家基于斯坦福在线RNA游戏发表论文

放大字体  缩小字体 发布日期:2018-08-27  来源:奇虎中国网  浏览次数:196
核心提示:

一篇由电子游戏玩家撰写的科学论文已被一家同行评议的期刊接受发表,这可能是自本杰明•富兰克林(Benjamin Franklin)时代以来,由非有资格证书的“公民科学家”领导的工作首次以这种形式出现。 /p 泰国试管婴儿 泰国试管婴儿成功率 雅堂 美国试管婴儿官方 试管婴儿检查方法 夏令营入营 怎样去泰国做试管宝宝

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这篇论文描述了一套新的规则,由一款叫做Eterna的电子游戏的玩家凭直觉推导出来,以确定设计由RNA分子组成的期望结构的难度。不像之前的众包工作,科学专家已经接触到在线游戏玩家,游戏玩家自己在这篇论文中起了带头作用。三位经验丰富的Eterna游戏玩家将其社区的想法提炼成在线谷歌文档,然后联系斯坦福大学医学院和其他地方的专家研究人员,使用高性能的超级计算机独立测试他们的想法。最终的论文将于2016年2月16日在线发表在《分子生物学杂志》(Journal of Molecular Biology)上。 /p 泰国试管婴儿 泰国试管婴儿成功率 雅堂 美国试管婴儿官方 试管婴儿检查方法 夏令营入营 怎样去泰国做试管宝宝


RNA一度被认为是活细胞中相对乏味的组成部分,但现在它被认为是生物学中几乎每一个关键过程的基础,并逐渐被认为是一种潜在的医学和工业工具。当每个RNA分子开始以一个线性亚基链的形式存在时,它会迅速折叠成一个热力学稳定的形状,这取决于分子的特定亚基组成序列。这种形状反过来又决定了RNA分子将与哪些细胞成分相互作用,以及如何相互作用。科学家们提高了计算模型和设计RNA的能力,为针对特定癌症、病毒、神经异常和遗传障碍定制的新一代基于RNA的疗法带来了希望。 /p 泰国试管婴儿 泰国试管婴儿成功率 雅堂 美国试管婴儿官方 试管婴儿检查方法 夏令营入营 怎样去泰国做试管宝宝


众包科学发现
该论文的资深作者、斯坦福大学生物化学副教授Rhiju Das博士说,这篇论文还将在3月份出版的《RNA设计》特刊上发表,专门研究RNA设计。这篇论文的研究不是由专家科学家指导或整理的,就像Eterna和其他科学发现项目之前的研究那样,而是由游戏社区的非专家进行的。他说:“重要的是要捕捉到这些见解,并通过在同行评议的期刊上发表,使它们既公开又可信。” /p 泰国试管婴儿 泰国试管婴儿成功率 雅堂 美国试管婴儿官方 试管婴儿检查方法 夏令营入营 怎样去泰国做试管宝宝


Eterna联合公司(俗称Eterna大型开放式实验室)的一个惊人发现是:对称的、悦目且折叠稳定的RNA分子也很难设计;理想的形状越对称,就越难实现。
2011年,由Das和卡内基梅隆大学计算机科学助理教授Adrien Treuille博士创立的Eterna俱乐部现在拥有超过10万的注册玩家。这款交互式在线视频游戏挑战玩家设计RNA的化学序列,这些序列可以稳定地折叠成所需的形状。就其热力学稳定性而言,这些序列看起来很有希望——正如评估这一特性的算法所预测的那样——在Das的实验室中合成,并测试RNA序列的实际结构。
任何13岁或13岁以上的人都可以登录游戏官方网站Eternagame.org进行注册。不需要任何特殊技能或生化训练。
“甚至不需要知道RNA是什么或做了什么,”Das说。
评级RNA-design困难
Das说,到目前为止,还没有建立关于rna设计难度的评定量表。生物医学研究人员无法轻易评估设计用于诊断或治疗的RNA结构的难度,因此可能会浪费大量的时间和金钱,试图创造出RNA分子难以想象的形状。即使为RNA设计获得一个评分尺度并不是Eterna的任务,经验丰富的Eterna玩家注意到这种难度评分对于指导新玩家从简单到复杂的“谜题”是多么有用。这些经验丰富的玩家自己编写了一份特殊特性列表,使得RNA的形状难以设计序列。他们使用自己的个人电脑进行测试。然后,他们联系Das实验室的科学家,用一组预测来测试他们的想法——一组假设的100个RNA形状,让Eterna玩家能够经受住从相对“可设计”到“难对付”的考验。科学家们利用斯坦福大学的超级计算机,用六种标准算法来测试这些预测,这些算法的目的是提供折叠成特定形状的RNA序列。他们发现,玩家的排名与算法解决这些谜题的能力密切相关。事实上,这是最难的谜题,而有经验的Eterna p才可以破解 /p 泰国试管婴儿 泰国试管婴儿成功率 雅堂 美国试管婴儿官方 试管婴儿检查方法 夏令营入营 怎样去泰国做试管宝宝

 
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